MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_4

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013367	ACGA	2	8	55	62	50 %	0 %	25 %	25 %	260751909
2	NC_013367	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751909
3	NC_013367	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	260751909
4	NC_013367	GCGT	2	8	336	343	0 %	25 %	50 %	25 %	260751909
5	NC_013367	TG	3	6	344	349	0 %	50 %	50 %	0 %	260751909
6	NC_013367	CGA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751909
7	NC_013367	GC	3	6	487	492	0 %	0 %	50 %	50 %	260751909
8	NC_013367	CCT	2	6	664	669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260751909
9	NC_013367	TCTAAG	2	12	799	810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260751909
10	NC_013367	GCAC	2	8	832	839	25 %	0 %	25 %	50 %	260751909
11	NC_013367	A	6	6	892	897	100 %	0 %	0 %	0 %	260751909
12	NC_013367	GTAGA	2	10	907	916	40 %	20 %	40 %	0 %	260751909
13	NC_013367	GGT	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751910
14	NC_013367	ACGC	2	8	1251	1258	25 %	0 %	25 %	50 %	260751910
15	NC_013367	CTT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751910
16	NC_013367	TCT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751910
17	NC_013367	ATC	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
18	NC_013367	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	260751911
19	NC_013367	CTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
20	NC_013367	TGA	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
21	NC_013367	TGGTG	2	10	1769	1778	0 %	40 %	60 %	0 %	260751911
22	NC_013367	CCGTT	2	10	1780	1789	0 %	40 %	20 %	40 %	260751911
23	NC_013367	GGACC	2	10	1966	1975	20 %	0 %	40 %	40 %	260751911
24	NC_013367	CAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
25	NC_013367	GC	3	6	2077	2082	0 %	0 %	50 %	50 %	260751911
26	NC_013367	CGT	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
27	NC_013367	GCT	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
28	NC_013367	A	6	6	2579	2584	100 %	0 %	0 %	0 %	260751911
29	NC_013367	TGA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
30	NC_013367	CGC	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751911
31	NC_013367	CCCG	2	8	2735	2742	0 %	0 %	25 %	75 %	260751911
32	NC_013367	GAAA	2	8	2800	2807	75 %	0 %	25 %	0 %	260751911
33	NC_013367	AGCGG	2	10	2824	2833	20 %	0 %	60 %	20 %	260751911
34	NC_013367	GGA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
35	NC_013367	GAAGCG	2	12	2849	2860	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260751911
36	NC_013367	GGAA	2	8	2865	2872	50 %	0 %	50 %	0 %	260751911
37	NC_013367	ACC	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751911
38	NC_013367	TTA	2	6	2943	2948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751911
39	NC_013367	AG	3	6	2966	2971	50 %	0 %	50 %	0 %	260751911
40	NC_013367	ATG	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
41	NC_013367	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
42	NC_013367	CGA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751911
43	NC_013367	AAC	2	6	3366	3371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751911
44	NC_013367	TGT	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751911
45	NC_013367	GA	3	6	3391	3396	50 %	0 %	50 %	0 %	260751911
46	NC_013367	CAG	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751911
47	NC_013367	TGT	2	6	3420	3425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751911
48	NC_013367	GGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
49	NC_013367	AGG	2	6	3472	3477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
50	NC_013367	ATG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
51	NC_013367	CAT	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
52	NC_013367	GCT	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
53	NC_013367	CAA	3	9	3761	3769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751911
54	NC_013367	CGC	2	6	3770	3775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751911
55	NC_013367	GC	3	6	4072	4077	0 %	0 %	50 %	50 %	260751912
56	NC_013367	TGG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
57	NC_013367	GGT	3	9	4125	4133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
58	NC_013367	GTG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
59	NC_013367	GGT	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
60	NC_013367	G	6	6	4233	4238	0 %	0 %	100 %	0 %	260751912
61	NC_013367	GGT	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
62	NC_013367	CAG	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
63	NC_013367	G	6	6	4432	4437	0 %	0 %	100 %	0 %	260751912
64	NC_013367	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
65	NC_013367	GAT	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
66	NC_013367	GTT	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751912
67	NC_013367	GAT	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
68	NC_013367	ACGA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	260751912
69	NC_013367	GTT	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751912
70	NC_013367	GGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
71	NC_013367	TAA	2	6	4739	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
72	NC_013367	CAG	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
73	NC_013367	ATA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
74	NC_013367	GGT	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
75	NC_013367	AGTG	2	8	4895	4902	25 %	25 %	50 %	0 %	260751912
76	NC_013367	AAC	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751912
77	NC_013367	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751912
78	NC_013367	CAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
79	NC_013367	CG	4	8	5010	5017	0 %	0 %	50 %	50 %	260751912
80	NC_013367	ATA	2	6	5251	5256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
81	NC_013367	TGC	3	9	5273	5281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751912
82	NC_013367	GATGCT	2	12	5295	5306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260751912
83	NC_013367	AGGTAA	2	12	5414	5425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260751912
84	NC_013367	GAT	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
85	NC_013367	CGA	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
86	NC_013367	GAA	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751912
87	NC_013367	TAAG	2	8	5578	5585	50 %	25 %	25 %	0 %	260751912
88	NC_013367	TAA	2	6	5600	5605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
89	NC_013367	A	6	6	5604	5609	100 %	0 %	0 %	0 %	260751912
90	NC_013367	TCA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751912
91	NC_013367	TCAG	2	8	5698	5705	25 %	25 %	25 %	25 %	260751912
92	NC_013367	TGG	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
93	NC_013367	ACTGAA	2	12	5816	5827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260751913
94	NC_013367	A	7	7	5831	5837	100 %	0 %	0 %	0 %	260751913
95	NC_013367	CAT	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751913
96	NC_013367	TGA	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751913
97	NC_013367	A	8	8	5871	5878	100 %	0 %	0 %	0 %	260751913
98	NC_013367	GAT	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751913
99	NC_013367	TCTGA	2	10	5930	5939	20 %	40 %	20 %	20 %	260751913
100	NC_013367	TTA	2	6	5941	5946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751913
101	NC_013367	TAA	2	6	5956	5961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751913
102	NC_013367	TTA	2	6	5982	5987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751913
103	NC_013367	GCT	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751913
104	NC_013367	A	7	7	6108	6114	100 %	0 %	0 %	0 %	260751914
105	NC_013367	ATT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751914
106	NC_013367	CTT	2	6	6135	6140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751914
107	NC_013367	ATT	2	6	6147	6152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751914
108	NC_013367	TCA	2	6	6210	6215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751914
109	NC_013367	TGT	2	6	6610	6615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751916
110	NC_013367	GAC	2	6	6899	6904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751917
111	NC_013367	GGT	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751917
112	NC_013367	TGA	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751917
113	NC_013367	ATA	2	6	6988	6993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751917
114	NC_013367	AAT	2	6	6996	7001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751917
115	NC_013367	GGTT	2	8	7002	7009	0 %	50 %	50 %	0 %	260751917
116	NC_013367	ATC	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751917
117	NC_013367	AAAGA	2	10	7155	7164	80 %	0 %	20 %	0 %	260751918
118	NC_013367	A	8	8	7203	7210	100 %	0 %	0 %	0 %	260751918
119	NC_013367	GA	3	6	7257	7262	50 %	0 %	50 %	0 %	260751918
120	NC_013367	TAT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751918
121	NC_013367	GCT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751918

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.